暴晒法：将砂子平铺在水泥地面上，所摊厚度为２－３厘米，利用太阳强光暴晒５－６天。由于具有杀菌作用的紫外线没有穿透能力，只能杀死砂子表面的细菌，所以在暴晒过程中要每天翻动砂子数次，以利于彻底杀菌。
漂白粉消毒：用稀释１万倍的漂白粉溶液澄清液浸泡砂子１－２小时，然后捞出砂子，沥干水分，放通风处晾晒，数天后即可用作孵化砂。需要注意的是：漂白粉只能用冷水溶解而不能使用热水溶解，以免失去杀菌作用；用漂白粉溶液澄清液浸泡砂子最好在傍晚日落时进行，以免阳光照射引起有效氯失效。
高锰酸钾消毒：把砂子放进箩筐中或漏水布袋中，用稀释５０００倍的高锰酸钾溶液将砂子淋透，待其晾干后即可用作孵化砂。注意：高锰酸钾固体必须先用温水溶化，然后再对足所需倍数的冷水，因为高锰酸钾固体在冷水中不易溶解，而直接使用开水稀释则会降低高锰酸钾溶液的杀菌效果。
煮沸法：把砂子放锅内加水煮沸１５分钟，冷却后捞出。在此过程中要防止砂子沾上油腻物后把龟鳖卵粒表面的透气孔阻塞，使未出壳的稚龟（鳖）窒息而死。
用作孵化的砂子必须事先过一次筛，除去过大或过小的砂粒后再用水淘洗、过滤，然后再进行消毒。
